トマトやきゅうりの本葉が重なりはじめたので間引きしました。

根元から切ってもいいですが、根から抜いて株分けし、小さなポットに植え替え、別で育ててもいいですよ。
トマトは５つあったものを３つ、きゅうりは１本にして、今後の成長を様子見です。